Основной лимитирующий фактор, то есть условие, сильнее всего ограничивающее выживание и размножение вида, — это уничтожение естественных мест его обитания. Например, как это произошло пару лет назад под Анапой, где под застройку отдали пустырь, на котором издавна обитали черепахи Никольского.
Другой мощный негативный фактор — все тот же незаконный отлов рептилий и их продажа, в том числе через интернет. А еще есть автомобили, под колесами которых гибнет немало рептилий; антропогенные ландшафтные пожары и синантропные хищники, например, крысы, собаки, вороны — в общем животные, которые приспособились жить рядом с человеком. Они тоже охотятся на черепашат.